制藥廠污水處理存在成分復雜、水質波動大、生物毒性強等諸多難點，以下是具體分析：
水質特性方面
成分復雜：制藥生產過程中會使用大量的原料、溶劑和助劑等，導致污水中含有各種有機物、無機物、微生物等。其中有機物可能包括抗生素、激素、生物堿、有機溶劑等，無機物可能有重金屬離子、酸堿物質等。這些成分相互交織，增加了污水處理的難度。
水質波動大：不同的制藥工藝、生產批次以及生產時間等因素，會使污水的水質和水量在很大范圍內波動。比如在藥品合成階段，污水中可能含有高濃度的有機溶劑和藥物中間體;而在清洗階段，污水的主要污染物可能是懸浮物和低濃度的有機物。這種水質水量的不穩定給污水處理工藝的設計和運行帶來了挑戰。
生物毒性強：許多制藥廢水中含有對微生物具有毒性的物質，如抗生素類物質會抑制甚至殺死污水處理過程中起關鍵作用的微生物，影響生物處理效果。重金屬離子也會對微生物的酶系統產生抑制作用，干擾微生物的正常代謝活動。
色度高：制藥污水通常帶有很深的顏色，這是由于其中含有各種帶有發色基團的有機物，如染料、色素等。這些帶色物質難以通過常規的處理方法完全去除，不僅影響水體的感官性狀，還可能對后續的深度處理造成影響。
處理技術方面
難降解有機物處理困難：制藥廢水中的一些有機物，如多環芳烴、雜環化合物等，具有很高的化學穩定性和生物惰性，難以通過傳統的物理、化學和生物處理方法徹底降解。這些難降解有機物可能會在環境中積累，對生態系統和人體健康造成潛在危害。
氮磷去除要求高：制藥廢水中的氮、磷含量往往較高，如果處理不當，會導致受納水體的富營養化。然而，由于廢水中碳源、氮源和磷源的比例可能不合適，以及一些含氮有機物的難降解性，使得氮、磷的有效去除成為一個難題。
污泥處理與處置問題：在制藥污水處理過程中，會產生大量的污泥。這些污泥中可能含有殘留的藥物成分、重金屬以及微生物等，具有較高的環境風險。如果污泥處理不當，如未經有效脫水、穩定化處理就進行填埋或焚燒，可能會導致二次污染。
成本與管理方面
處理成本高：由于制藥污水處理需要采用多種處理工藝的組合，如預處理、生物處理、深度處理等，涉及到大量的設備投資、藥劑消耗和能源消耗。同時，為了確保處理效果，還需要專業的技術人員進行運行管理和維護，這使得處理成本居高不下。
監管要求嚴格：隨著環保要求的不斷提高，制藥行業的污水處理受到越來越嚴格的監管。制藥企業需要滿足更高的排放標準，這就要求企業不斷改進和完善污水處理設施，增加監測頻率和項目，加大了企業的環保管理壓力。
